卵巢囊肿术后复发率确实有的种类比较高，比如巧克力囊肿。大多时候的巧克力囊肿，切除过程中并不能够很完整的去掉病灶，很多是肉眼看不到的卵巢内病灶或者是盆腔病灶。
而且还是在育龄期，卵巢还在周期性地分泌雌激素，残余的病灶是有可能会逐渐地长大，逐渐再次形成囊肿，也有少数患者需要再次进行手术治疗的可能。
在做了巧克力囊肿的切除手术之后，也是应该注射或者口服孕激素或者其他的药物进行抑制治疗，尽量预防复发。其他类型的卵巢囊肿也存在复发的可能，也是在必要时要加强复查。