肛门多了个小肉疙瘩的处理办法需结合疙瘩性质来定。
如果肛门小疙瘩是痔疮，多是黏膜下血液淤积形成的凸起。若是久坐或者辛辣食物饮食时发作，肛门处会有疼痛和异物感，病患可以使用高锰酸钾溶液坐浴，也可以涂抹痔疮膏缓解，能还纳的尽可能还纳。然后改变生活和饮食习惯，当小疙瘩出现暗紫色肿胀血栓时，应尽早手术切除。
如果肛门处的小疙瘩是肛门息肉，正处于息肉炎症发作期，可以服用消炎药消除炎症，也可以局部涂抹消炎药膏缓解。处于息肉稳定期，需要定期复查，避免息肉短时间内生长迅速，甚至癌变等。