儿童出现肛门有个小肉疙瘩首先要到医院去确诊病因，因为肛门出现小肉疙瘩有可能是因为痔疮、肛乳头瘤或者是肠道息肉所导致。
如果是因为痔疮脱出肛门充血、水肿所引起的小肉疙瘩，可以先采取保守治疗，每天可以用高锰酸钾兑温水坐浴，局部可给予肛门内塞痔疮栓，外面涂抹痔疮膏可以消炎、止痛、消肿促进疙瘩的缩小，甚至消失。
平时饮食要避免吃辛辣、刺激性的食物，容易上火的食物，多吃蔬菜、水果保持大便通畅。如果是因为肠道菌群所引起便秘，可以服用益生菌调理改善便秘对于治疗痔疮有好处。
如果是因为肛乳头瘤或者肠道息肉所导致的肉疙瘩需做手术切除治疗。因此儿童肛门内的小肉疙瘩要根据病因来选择治疗方法。