骨骼肌肉系统先天性畸形非常多。比如：
先天性斜颈：由于一侧胸锁乳突肌挛缩，引起的头颈歪斜的先天性颈部畸形。
先天性高肩胛症：特征是肩胛骨处于较高的位置，患侧肩关节高于健侧，患肢上臂上举活动受限，可同时合并有肋骨、颈、胸椎的畸形。
先天性髋关节脱位：以后脱位为多见，出生时即已存在，病变累及髋臼、股骨头、关节囊、韧带和附近的肌肉，导致关节松弛，半脱位或脱位。
先天性髋内翻：本病最突出的表现是日益加重的跛行。婴儿时症状不明显，早期以髋痛为主，之后患肢无力，易疲劳，行走时身体摇晃、跛行。