胃食管反流病可以根据症状和辅助检查结果确诊。
如果经常出现反酸、烧心，尤其是吃完东西后容易出现这些症状，少部分患者还会出现胸痛，在排除心绞痛后，需要高度怀疑胃食管反流病，此时可以进一步做电子胃镜检查。如果镜下可以直接看到食管内有反流的胆汁或食管黏膜发生糜烂，可以明确胃食管反流病的诊断。
如果食管黏膜没有明显的破损，也没有看到反流的胆汁，而患者症状比较典型，此时又高度怀疑胃食管反流病时，可以进一步做食管24小时pH监测、标准酸反流试验或胃食管反流的核素检查。如果这些检查阳性，也支持胃食管反流病的诊断。