功能性的消化不良经过客观检查，已经排除了器质性的疾病，比如排除了溃疡、胃癌，甚至胆道的一些疾病。症状持续反复的出现，病程超过1个月或者是过去12个月中累计超过12周，是一种功能性的疾病。功能性消化不良多久能好，这不是一个明确的定论，而且是一个慢性疾病，经常是容易反复出现，所以需要综合调理。
如果是短期内由于吃了一些不消化的食物或者是焦虑，这种心情郁滞引起的功能性消化不良，随着这种饮食结构的改善以及心情的改善，消化不良多可以缓解，比如一周的时间。如果确实是功能性消化不良，而且长期有一些诱因不能去除，就会慢性存在，反复发作。
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