斑疹伤寒立克次体肺炎并发症较常见的并发症是中毒性肝炎，支气管肺炎，心肌炎，脑膜脑炎和急性肾衰竭等，其他尚有中耳炎、腮腺炎等，偶见趾、指、阴囊、耳垂、鼻尖等坏死或坏疽，以及走马疽，胃肠道出血、胸膜炎、流产、急性肾炎等。轻型病例和复发型斑疹伤寒很少有并发症。若能及时诊断与治疗，绝大部分患者预后良好。若有并发症则预后较差。病死率各地报告不一，在1%～50%之间。病死率除与斑疹伤寒立克次体的株间毒力强弱差异有关外，还与病程的长短有关。进入病程的第3～4周后，患者常出现明显的多器官功能损害，患者可因多器官功能衰竭或发生肺、消化道大出血而死亡。患者出现流行性斑疹伤寒的时候，伤寒的时候可能会导致患者出现一些精神上的症状，这个时候患者还可能会出现有一些精神上的疾病，比如说还可能会出现嗜睡，以及昏厥。
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