同位素治疗主要是指放射性的核素，临床上常见的是碘131的治疗，很多甲状腺癌患者手术后会淋巴结转移等高危因素，一般会建议做碘131的治疗。
碘的粒子也可以做成放射性的粒子，接种在肿瘤的局部，可以种上百颗，将局部大的肿瘤通过放射杀死。同位素的治疗还包括像钴60、铱192，不同的放射性核素活度不一样，半衰期不一样，治疗起来防护也可能不一样。
碘131的防护相对简单，但是像钴60、铱192防护是比较难的，这些射线的穿透力很强，治疗时家属要注意防护。但是对于患者的正常生活不会造成影响，碘131因为是近距离的放疗，治疗后也不需要隔离。
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