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霉菌性肺炎是不可以自愈的。诊断了霉菌性肺炎，应该及时到正规医院，在专科医生的指导下，科学、规范的进行治疗，使病情得到有效控制。
首先要找到病原学的依据，留取痰培养，或者在支气管镜下留取灌洗液，根据药敏的结果，针对性的使用抗真菌药物，疗程至少三个月以上的时间。同时要注意抗真菌药物的不良反应，密切监测患者的血细胞分析、肝功能、肾功能等情况。
加强对症支持治疗，注意休息，不要熬夜，保证充足的睡眠，使体力得到恢复。加强营养，进食一些富含维生素和蛋白质的食物，如新鲜的蔬菜和水果、牛奶、瘦肉、鱼肉等。
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