尿路感染绝大部分是细菌性的感染，通常会根据诊断的程度不同，来考虑应用抗生素，比如口服的抗生素或者是静滴的抗生素，通常对于普通的泌尿系感染或者常见的轻到中度的泌尿系感染，通过经验来给应用抗生素，来覆盖泌尿系感染常见的菌群的抗生素。
也有的泌尿系感染的患者服用抗生素或者静滴抗生素7天以上，或者3天、5天，没有明显的好转，医生会给患者做尿细菌的培养以及药敏的实验。通过个体化的细菌培养的结果和抗菌素的选择，应用更加适合的抗生素来进行感染的控制。往往就会更加精确的个体化治疗，使得治疗的效果会更加的明显，治疗的时间也会变短。
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