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小部分人感染了丙型肝炎后可以自愈，但仅有15%，大部分是不可以自愈。有的人甚至没有肝炎的症状，也没有检测肝功，只是查体的过程中发现了丙肝抗体阳性，但是体内已经检测不到丙肝的病毒核酸，就认定是自愈的病人。多数的患者感染丙肝病毒后是不能自愈的。如果在急性感染期的8~12周之后，仍然在病人的血清中可以检测到丙肝病毒，证明很难发生自愈，可以考虑开始丙型肝炎的抗病毒治疗且应尽早治疗，因为治疗越早疗效越好。
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