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小三阳转阴非常困难，可以通过干扰素治疗转阴，但是有再次转阳的可能。通常乙肝小三阳就是表面抗原阳性、E抗体阳性和核心抗体阳性，这三个同时出现阳性叫做小三阳。目前小三阳转阴很难，主要原因是乙肝病毒cccDNA很难被清除，就像一个种子一样，没有药物能根除。但是干扰素治疗可以降解部分患者是表面抗原，达到转阴的目的。但是表面抗原转阴后，也需要密切监测，因为有再次转阳的可能，所以目前小三阳转阴比较困难。
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