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大部分肝多发囊肿是先天性疾病，是胆管在发育过程中畸形引起的肝囊肿，通常不需要吃药和治疗，定期观察囊肿即可。 但是肝囊肿的一种特殊类型，如Caroli病是先天的显性遗传疾病，囊肿会随着年龄逐渐增大，导致肝功能和肾功能受到影响，所以需要手术干预或者进行介入治疗。 另外，肝脏的囊性肿瘤和肝包虫病也会出现多发囊肿，需要进行鉴别诊断。
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