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输尿管结石手术可以引起感染，主要是来源于两方面：第一方面，输尿管结石本身可以导致感染，输尿管结石阻塞了输尿管，本身可以导致输尿管和肾盂的炎症，可以引起感染。另一方面，手术时，做输尿管手术时一些操作，比方所用的器械、操作的医生等，如果操作不规范，消毒不严格，同样可以把细菌带入输尿管和肾脏，同样可以引起感染。所以做手术一定要到正规的医院，正规的手术室、医疗部门。一般来讲，这样情况可以避免一些医源性的，由于医生原因导致的感染。结石引起的感染，可以在术前和术后通过使用消炎药物来控制。
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