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造血干细胞移植会出现感染、移植物抗宿主病、肝肾功能损伤、移植后淋巴增殖性疾病、渗漏综合征、血栓性微血管病等并发症。 感染是造血干细胞移植后最常见的并发症之一，包括细菌感染、真菌的感染、病毒，尤其是EB病毒和巨细胞病毒是最常见的病毒感染。 移植物抗宿主病包括急性移植物抗宿主病和慢性移植物抗宿主病，发生率非常高。 另外，很多移植过程中使用的药物，对肝肾功能有损伤，可以造成肝肾功能的损伤。 所以，造血干细胞移植有很多各种各样的并发症，需要大夫积极的判断与救治。
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