PNH患者的平均寿命大多在13年左右，部分比较轻的患者的寿命可能会有所延长，如果患者在患病期间规范治疗，或有条件进行骨髓移植这种治疗手段，预后的情况就会有所改观。
PNH这种疾病将之称为阵发性睡眠性血红蛋白尿症，大部分患者在发病之后的死亡原因，可能是由于感染，或者是形成血栓和出血所引起的死亡现象。
这种疾病还有可能转化为再生障碍性贫血，少数患者有可能转化为骨髓增生异常综合征或者急性白血病等等。当转化为其他疾病的时候，患者的治疗效果不佳。
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