美克尔憩室很严重，是由于先天性的胚胎发育过程中，卵黄管退化不全导致的先天畸形，大多数美克尔憩室都存在异位的胃黏膜和胰腺组织。
异位的胃黏膜和胰腺组织，发生溃疡、糜烂、穿孔，会导致大量地出血，导致美克尔憩室穿孔，导致腹膜炎，有的会危及生命。
极少部分不含有异位的胃黏膜和胰腺组织，这样的病例可能终身都不会出现症状，也不会被发现。
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