基本外科和普通外科的区别级别不同、涵盖的范围不同、所包含的内容不同等。
1.级别不同。基础外科属于医学上的二级学科，而普通外科仅属于三级学科。
2.涵盖的范围不同。基础外科所涉及的范围比较广泛，包括心胸外科、普通外科、肝胆外科、矫形外科、烧伤整形科等科室，而普通外科仅是基本外科中系统最大的专科。
3.所包含的内容不同。基本外科是临床上研究疾病发展规律，并予以诊断、治疗、预防等综合性的科室，所涉及的疾病范围比较广泛，包括畸形、功能障碍、创伤、肿瘤感染等。而普通外科则是以手术切除以及修补为主要治疗方案的专业科室，主要针对肿瘤、创伤等两大类疾病。
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