甲胎蛋白偏高可能是生理性的表现，但也可能和病理性的原因有关。
1.生理性的表现。在临床上有部分妊娠的女性，可能会出现甲胎蛋白一过性升高。此时的甲胎蛋白偏高和胎儿发育有关，当胎儿的肝脏形成后，也会分泌甲胎蛋白，当甲胎蛋白通过胎盘进入母体时，也可有甲胎蛋白偏高的现象，通常在生产之后可恢复正常。
2.病理性的原因。例如性慢性肝炎、急性肝炎、肝硬化等肝部疾病时，也可能会出现甲胎蛋白偏高。当发生肝部疾病时，由于肝细胞受到损害，因此肝脏在修复的过程中，可能会分泌出较多的甲胎蛋白，进而引起甲胎蛋白偏高。通常在肝功能逐渐恢复后,甲胎蛋白也可逐渐恢复着正常的范围。
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