胃肠造影和胃镜检查相比，胃镜检查帮助诊断的效果较好。
胃肠造影一般是口服硫酸钡，然后做X线检查，硫酸钡不被X线穿透，当填充食管、胃肠道时能够显示出胃肠道里的一些结构和病变，从而帮助诊断。
胃镜是镜子直接进到食管、胃和部分十二指肠，直接观察这些结构的黏膜，镜下看的要比胃肠造影看得清晰，能发现一些造影观察不到的病变。比如早期食管癌、胃癌，而且胃镜下能够取病变处的组织做病理检查，更有助于诊断。
此外，做胃肠道造影带来的不适感要比胃镜检查强烈，而且一些怀疑患有肠梗阻、胃肠道穿孔的患者，不适合做胃肠造影。
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