乙肝E抗原弱阳性可能是感染乙型肝炎病毒后，因为体内有抗体，正处于病毒清除期，或已经处于乙型大三阳或小三阳阶段。
对于体内有乙肝表面抗体、乙肝核心抗体等抗体的人群，从性传播、血液传播等途径感染乙型肝炎病毒后，身体中的抗体会自动清除乙型肝炎病毒使身体避免出现感染。在乙肝病毒清除后的恢复期，会出现乙肝E抗原弱阳性的现象。
乙肝E抗原弱阳性不会单独存在，如果身体中的抗体不能完全清除，还可能会出现乙肝表面抗原阳性、乙肝核心抗体阳性的情况，发展为乙肝大三阳或乙肝小三阳。此时需要在医生的指导下使用药物改善病情，常用药物有干扰素、恩替卡韦等。
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