幽门螺旋杆菌的一般治疗方案以14天为一个疗程，一个疗程的治疗成功率可以高达70%~80%以上。不同的患者会由于个人的体质的不同，而会产生某些区别。
有些患者可能在1个疗程之后，病情还没有完全恢复，需要反复进行治疗。在临床医学上也会出现较多的治疗了2个疗程以及3个疗程以上的病人。也会存在一部分人经过反复的治疗之后，对许多药物存在耐药性，所以病情没有得到完全恢复。
幽门螺旋杆菌的耐药性越来越高，治疗的难度也会逐渐增大。在目前，幽门螺旋杆菌的治疗疗程最短一般在14天左右。
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