内分泌功能失调会引起来月经不规律。最常见的是更年期，更年期由于激素水平的下降，导致了患者月经的减少以及闭经，这是比较常见的，与生理状态是相关的。
还有如果是内分泌的功能紊乱，造成的月经紊乱还有很多种，比方说垂体功能减退，垂体功能减退常常见于产后大出血，以及垂体的肿瘤导致的垂体的促性腺激素水平下降，性腺激素水平下降，最后导致的月经的稀发、不孕、闭经，这是垂体功能减退。卵巢早衰也会影响月经。
还有一种甲状腺功能减退，也会导致月经的紊乱，这个月经紊乱往往是月经量的增多，月经周期的缩短和甲状腺功能亢进是相反的。还有就是经常会见到的PCOS综合征，PCOS叫多囊卵巢综合征，目前主要是两大激素的紊乱造成的，高雄激素血症和高胰岛素血症，引起月经稀发或闭经。
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