细菌性痢疾总是反复发作，可能和痢疾杆菌重复感染、细菌容易造成感染、治疗不彻底等原因有关。
1.痢疾杆菌重复感染。由于痢疾杆菌种类比较多，常见的有志贺菌群、福氏菌群、鲍氏菌群等，这些杆菌都有变异性的亚型，并且每个菌群都有一种抗原。由于它们互相之间没有交叉的免疫，以前得过细菌性痢疾的患者并没有起到很好的免疫保护效果，所以还有可能再次感染痢疾杆菌。
2.细菌容易造成感染。细菌性痢疾主要通过消化道传播，当带有痢疾杆菌的粪便排出人体后，可污染手、苍蝇、食物和水等。由于传播途径比较复杂，对日常环境污染较为广泛，最终经口腔进入人体消化道后可造成感染。
3.治疗不彻底。如果细菌性痢疾治疗不彻底，比如部分病人没有遵医嘱进行治疗，或者治疗几天后觉得症状有所缓解就私自停药。由于病情没有得到完全控制，所以可能会导致病情反复发作。
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