儿童幽门螺杆菌可以自愈主要是由于免疫系统不完善所出现的现象，并非所有的儿童在感染幽门螺杆菌后都可以自愈。
由于儿童的自身免疫系统发育尚不完善，感染幽门螺杆菌后，自体的免疫细胞可能会将幽门螺杆菌进行自我清除，所以少部分的儿童在感染幽门螺杆菌后会出现自愈的情况。但随着儿童的年龄逐渐增加，免疫系统不断完善，等到儿童成年后如果体内仍携带幽门螺杆菌，将无法达到自愈的目的。
还有一些儿童在感染幽门螺杆菌后不会出现自愈的情况，因为儿童属于幽门螺杆菌的易感人群，在对幽门螺杆菌治疗时可能会出现对抗生素不敏感的情况。对于儿童感染幽门螺杆菌的情况，建议积极配合医生进行药敏试验，根据药物敏感程度选择合理的抗生素进行治疗。
幽门螺杆菌感染的儿童家长也应该前往医院完善碳14呼气试验，以防止幽门螺杆菌交叉感染的情况发生。
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