乙脑和流脑的区别在于病原体不同、好发季节不同、临床表现不同等。
1.病原体不同。乙脑主要是由乙脑病毒感染而诱发的急性中枢性神经传染性疾病，可能是通过蚊虫叮咬的方式而进行传播，病毒侵入机体之后会促使免疫能力下降，会入侵中枢神经，诱发脑实质病变。流脑主要是由脑膜双球菌而引起的化脓性脑膜炎，致病菌会通过鼻咽部的方式进入血液循环当中，从而会侵入脑膜以及脊髓膜，形成化脓性脑脊髓膜病变。
2.好发季节不同。乙脑在热带地区全年均可发生，但是在温带地区可能会有较严格的季节性，通常会在夏秋季节发病。流脑在温带地区可能会出现地方性流行，通常好发于冬春季。
3.临床表现不同。乙脑发病时会出现恶心、头痛、高热等症状，严重者还会出现肢体瘫痪、失语、意识障碍。流脑主要是会出现发热、头痛、咽痛、皮肤瘀点、瘀斑、肌肉酸痛，严重者可伴有脾肿大、关节痛。
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