细菌性肺炎与支原体肺炎的分辨从临床症状、辅助检查来辨别。
支原体肺炎其突出症状是以干咳或刺激性的咳嗽为主，一般无明显咳痰，有时还可以伴有明显的肺外症状。细菌性肺炎多伴有咳嗽、咳痰的现象，可以咳淡黄痰或脓血性痰。
其次，根据胸片检查来分辨。支原体肺炎多显示双肺斑片状浸润阴影，以中下肺叶较为明显，有时可以呈网状、云雾状、间质性改变、而且多变，患者胸部影像学检查表现重、而临床症状相对于轻。而肺炎肺部浸润阴影和实变影更明显，有时还可有坏死性空洞形成等。另外，根据病原学检查可以鉴别，特别是支原体IgM抗体和IgG 抗体阳性可用来确诊。
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