乙肝的窗口期一般在两周到三个月，通常不会超过六个月。
乙肝的窗口期主要是指乙肝病毒进入机体之后，人体的免疫系统消灭乙肝病毒，但乙肝表面抗体还没有形成的时期。由于此时乙肝表面抗体以及乙肝表面抗原均属于阴性，因此在临床上也称为乙肝窗口期。乙肝窗口期时间的长短可能会有所差异，通常和机体的免疫能力有关，但大多在两周到三个月，仅有少数的人群窗口期可能会有所延迟，但通常不会超过六个月。
乙肝的窗口期即使患者已经感染乙肝病毒，由于病毒的抗体不稳定，因此可能未检测出，通常需要在专业医生的指导下，间隔一段时间之后再次进行检测。
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