肺部霉菌感染采取以下方式进行治疗，留取痰培养或者血培养，或者在支气管镜下留取灌洗液，根据药敏的结果针对性使用抗真菌药物。抗真菌疗程至少三个月以上的时间，期间要定期复查肺部CT等检查，观察肺部病灶的吸收情况，及时调整治疗方案。
同时积极地治疗原发病，如果有肺结核，要积极地抗结核治疗；如果是慢阻肺急性加重，要积极地抗炎、抗感染、平喘等治疗；如果是支气管扩张患者，要积极地抗感染、化痰等处理。
加强对症支持治疗，如果出现高热，可服用一些比较温和的退烧药物。补充水分，多吃新鲜的蔬菜和水果。加强营养，进食一些优质高蛋白的食物，提高身体的抵抗能力。
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