乳腺核磁共振和乳腺钼靶检查相比，乳腺核磁共振检查准确率更高一些，能够对乳腺整体情况，包括乳腺附近组织脏器进行分析，可以判断分析乳腺内部病变情况，以及附近组织是否发生侵袭，对于乳腺癌等病变具有较高的诊断意义。
但是，由于乳腺核磁共振检查费用较高、检查时间较长，并且如果进行内固定手术或者身体内放入金属物体，是无法进行核磁共振检查的。因此，对于部分患者，存在一定检查局限性。
而钼靶检查具有操作简单、检查时间短、可重复操作，对患者要求较低。因此在临床检查过程中，一般情况下会首选乳腺钼靶检查。检查过程中，如果发现存在可疑病变情况，可以考虑进行核磁共振检查，综合分析病变情况。
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