巨吻棘头虫病症状的严重程度与寄生虫的数量有关，患者可能有阵发性腹痛、腹泻、消瘦、贫血、恶心、呕吐、失眠、夜惊等神经心理症状。少数病人可能出现肠穿孔或肠梗阻，部分病人可能触及腹部肿块。
根据该虫的临床表现和病史，一些患者可能因服用杀虫剂而驱逐虫体或在手术中发现因急腹症导致的虫体，从而鉴定虫体的形态特征。
腹痛者给予解痉药，营养不良、贫血者应该加强营养、补充铁。肠道疾病发展为急腹症时，应该考虑立即手术，并将虫体取出。
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