红细胞压积低的原因常见的有怀孕、年龄增长等生理因素，或有消化系统、免疫系统、血液系统等疾病的病理因素。
怀孕期的女性或年龄比较大的患者，容易因为营养摄入不足、营养流失过多等现象，导致微量元素缺乏导致红细胞减少，造成红细胞压积低。这种属于生理性的现象，一般不需要采取特殊治疗，增加营养摄入可起到改善病情的作用。
有胃溃疡、十二指肠溃疡等消化系统疾病，容易导致肠道发生持续出血现象，使红细胞数量减少，引起红细胞压积低。有干燥综合征、系统性红斑狼疮等免疫系统疾病，可能会导致红细胞遭到红细胞抗体的破坏，造成以上情况。缺铁性贫血、再生障碍性贫血等血液系统疾病，容易使患者发生贫血，出现红细胞压积低。
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