脑疝是一种神经系统的危急重症，对人体有非常大的危害，如果处理不及时，会导致一些永久性的神经损害，甚至会使患者死亡。
一些小脑幕切迹疝，时间久了以后会压迫动眼神经、脑干，这种情况下会引起瞳孔散大，会出现脑干的缺血、坏死，导致明显的意识障碍，患者会陷入深度的昏迷。有些即使抢救成功，也会留下永久的后遗症，比如长期昏迷、植物生存等。
如果是枕骨大孔疝，危害就更大。有可能会压迫刺激心跳、呼吸中枢，会导致心跳、呼吸骤停，会引起患者急性死亡。