球孢子菌病的病原菌为粗球孢子菌，该菌属双相型真菌。当病原菌断裂成关节孢子时，其传染性大。
该病的感染途径一般为以下几方面：
1.动物：牛、羊、狗可以被感染。粗球孢子菌在不同环境下可以表现不同形态，在37℃组织内为酵母型，28℃培养基上为菌丝型。从流行地区的土壤中可以被分离出来，在干燥沙土中也能生存。
2.人：本病多数经呼吸道传染，由吸入带有含有本菌关节孢子的尘土而感染。也可以发生实验室内感染，但目前尚未发现存在人与人或人与动物间的直接传播。