藏毛囊肿和皮脂腺囊肿的区别还是比较明显。
藏毛囊肿发生的部位一般比较局限，主要是发生在骶尾部位，而且这种皮损的范围也是比较局限。而皮脂腺囊肿发生的部位，大多是位于皮脂腺比较发达的区域，通常在颜面部位，或者是前胸以及后背部位等。
藏毛囊肿这种疾病的囊肿内容物主要是一簇的毛发，但是皮脂腺囊肿的内容物是没有毛发。因为皮脂腺囊肿形成，主要是皮脂的异常分泌而导致的皮脂腺导管的囊状扩张，最终形成这种皮肤损害。但是藏毛囊肿所形成的皮损，可能是因为局部的毛发进入到局部组织内，形成肉芽肿的损害，并且伴有化脓和疼痛的现象。