白塞氏病的治疗主要以药物治疗为主。少数出现严重并发症的患者需要手术治疗。白塞病属于自身免疫性的疾病，主要的治疗药物以抑制免疫反应为主，常用的药物有糖皮质激素。糖皮质激素主要用于严重患者的急性期治疗，能够快速地缓解患者的病情，部分患者可以使用冲击疗法。
以结节红斑为主的患者，可以使用秋水仙碱治疗。出现严重口腔溃疡的患者可以服用沙利度胺，可以使用环孢素抑制炎症反应，延缓病情的进展速度。
目前还可以使用新药英夫利昔单抗，效果比较明显，不良反应比较少。出现血管病变的患者要进行手术治疗，防止血管破裂。