二糖酶缺乏症又称双糖不耐受症，是指各种先天性或后天性疾病使小肠黏膜刷状缘双糖酶缺乏，使双糖的消化、吸收发生障碍，进食含有双糖的食物时发生的一系列症状和体征。
分为原发性和继发性双糖酶缺乏症，其中包括乳糖酶、蔗糖酶、麦芽糖酶、海藻糖酶等缺乏，以乳糖酶缺乏症最常见，乳糖酶缺乏症又称乳糖不耐受症或乳糖吸收不良症。
乳糖酶能使乳糖分解为半乳糖和葡萄糖，由于乳糖酶缺乏，使患者进食乳糖后仅有轻微的双糖吸收，余则均进入小肠下段，肠腔的细菌使双糖发酵产生乳酸等有机酸及二氧化碳和氮气，未吸收的双糖使肠腔内渗透压增高，肠道水分吸收减少引起腹泻，有机酸对肠道作用使排出酸性粪便，由于产气过多，引起腹胀及肠鸣。