角膜炎和结膜炎在发病部位、临床表现、严重程度上都存在区别。
首先角膜炎主要是病原体感染角膜导致的感染，从而导致角膜出现水肿、混浊，患者会自觉眼痛、畏光、视力下降，严重者可以出现角膜溃疡、穿孔、前房积脓等症状。因此角膜炎患者确诊后需要及时进行治疗，避免导致失明。此外角膜炎病程较长，需要定期复查及时调整用药。
而结膜炎主要发生在结膜，患者多会出现结膜充血、明显异物感、瘙痒等，但一般不会出现视力下降，且病程较短，早期及时使用抗菌药物治疗，即可控制病情。