甲状腺功能减退伴发的精神障碍病因，首先甲减分为原发性、继发性两类。原发性占90%，往往是后天获得。有以下的原因，一、甲亢治疗或者是手术切除后出现了甲状腺素合成分泌不足。二、甲状腺炎症。三、应用甲状腺腺素过量抑制甲状腺素合成。四、遗传缺陷引起的，甲状腺素合成唯一的系统功能失常。五、地方性呆小病的患者，往往是因为母体缺碘导致了胎儿期的甲状腺素合成分泌不足，导致的甲状腺功能减退。
甲状腺功能减退伴发的精神障碍的临床当中有以下的解释。
第一、脑循环障碍学说。提出甲减所致的精神障碍，是因为甲状腺素缺乏导致脑的代谢改变，这不仅是对脑组织的直接影响，也因为心脏受累影响到的循环障碍。脑组织出现低氧血症。
第二、有专家认为，粘液水肿所致的精神障碍，是因为脑水肿或者是脑内蓄积神经纤维蛋白物质，或者是由于动脉硬化导致循环功能减退引起的。
第三、甲状腺系统活性是维持正常行为和应急反应的一个重要成分。甲状腺素的治疗抑郁症已经获得了肯定，所以说，甲状腺素低下与抑郁情绪的关系十分密切。谢谢！