对于先天性脂肪营养这个疾病，目前还没有特别有效的治疗方法，该病的主要治疗手段依然是对症治疗，或者利用手术改善它的症状。
由于营养不良所引起的脂肪萎缩，平时患者要注意加强营养，同时需要补充一些维生素，必要的时候可以使用类固醇激素进行治疗。对于一些范围比较小，局限性皮下脂肪萎缩的病人，可以采用手术治疗，也就是自体脂肪填充术，来改善患者的临床症状。
但是该疾病仍然不好治愈，患者应该长期的保持一种良好的心态，积极进行治疗，逐步促进病情改善。所以，要重视先天性脂肪营养不良的治疗。