扁平苔藓和口腔溃疡，主要有以下的区别：
第一，扁平苔藓的发病原因，可能与免疫、病毒感染、遗传等有关系。而口腔溃疡可能是维生素缺乏、营养不良等引起。
第二，扁平苔藓的患者，口腔黏膜可出现浅表糜烂面，表面可有细浅的白色条纹，用石蜡油涂上后更加明显，一般仅有轻微的疼痛，患者身上可有紫红色的扁平丘疹。而口腔溃疡的患者，创面较深，周围红肿，表面没有白色的条纹，患者常常感到明显的疼痛。
第三，扁平苔藓治疗相对较难，很少会自愈。而口腔溃疡，一般对症治疗即可，可能会自愈。