不同的核酸检测只能检测出来所要检测的疾病。因此对于新冠病毒的核酸检测，只能检测出患者是否罹患新冠病毒。而对于其他病毒的核酸检测，才能看患者是否是出现其他病毒的感染。
目前新冠病毒肺炎的诊断金标准是采用核酸进行测定，病毒进行核酸测定的方法通常是荧光定量的PCR方法。
目前以新冠病毒为例，采取患者的口咽分泌物或者粪便等等检测其中是否存在新冠病毒的病原体核酸，然后根据检测到荧光信号的强弱来进行诊断。