矮小症和侏儒症有很大的区别。
首先两者之间概念有所不同，矮小症是指生长速度慢，而且比同龄儿童的平均身高要矮。大部分的矮小症智商低于正常人，而且有可能会出现情绪不稳定。而侏儒症是指身高低于同一种族，大部分的侏儒症患者智力正常。
除此以外引起疾病的病因也有所不同，而矮小症可能是内分泌疾病所引起，比如脑垂体分泌生长激素异常。大部分的侏儒症是因为遗传的基因问题，导致生长激素分泌不足。
在治疗上，两种疾病的治疗方式也有所不同。