华支睾吸虫病的防治原则包括两个方面：
一、是预防。首先要避免感染华支睾吸虫。华支睾吸虫主要寄生在淡水的鱼虾的体内，故烹调食物时要保证高温加工熟透，如果进食未加工熟透的鱼虾就有可能感染此寄生虫。对患者的粪便也要加强管理，进行杀虫的处理，防止污染水源。
二、是治疗。对于感染华支睾吸虫的患者要给予驱虫的药物治疗，首选的药物就是吡喹酮，吡喹酮可以有效的消灭华支睾吸虫，驱虫的同时要对患者进行对症治疗，比如保肝、纠正贫血等。