脑脊液培养不出细菌通常可能与未发生颅内感染、发生病毒性的颅内感染以及脑脊液培养检测前应用了抗生素等因素相关。发生颅内感染通常可行脑脊液的检查以明确诊断，包括脑脊液的常规、生化检查及脑脊液的细菌培养等。当脑脊液培养不出细菌可能包括以下因素：
第一，患者可能无颅内感染而发生菌血症引起高热现象，因此患者脑脊液的培养无细菌生长。
第二，患者可能是发生了颅内的感染，但患者颅内的感染引起的致病菌为病毒性的感染，因此脑脊液也培养不出细菌。
第三，绝大多数颅内细菌性感染在行脑脊液细菌培养之前，因为根据临床的症状以及头颅CT检查后都应用了抗生素抗感染治疗，所以绝大多数患者脑脊液培养不出细菌也较正常。但脑脊液常规发现细胞计数增高，脑脊液生化发现蛋白增高、含糖量降低等现象。