有些类型的男性生殖器畸形会导致内分泌失调，在男性生殖器畸形中，睾丸畸形是最常见的类型，由于人体内的雄激素主要由睾丸形成，所以如果睾丸发生畸形，会导致体内雄激素水平升高或者下降，引起内分泌失调。
无睾症在临床上少见，主要是在胚胎时期睾丸分化不全导致萎缩，由于还存在部分间质细胞，所以可以呈现男性外生殖器的表现。
多睾症是指体内存在3个或3个以上的睾丸，每个睾丸的大小、形态以及功能都正常，多睾症导致体内雄激素水平比正常人要高，可以引起内分泌失调而导致一些并发症。