胆囊结石老是半夜疼的原因如下：
首先，因为迷走神经往往会在夜间比较兴奋，从而导致胆囊收缩，进而加重胆囊炎的症状。出现胆绞痛或者导致结石进入胆囊颈部引起结石嵌顿，引起胆囊管梗阻，出现疼痛不适。
其次，晚上周围环境比较安静，患者对于身体的一些不适反应尤为敏感，即使出现轻微的疼痛，也会觉得无法忍受。
此外，患者半夜腹痛，也有可能是胆结石之外其他的原因。比如胃溃疡患者经常会在半夜出现腹痛，症状和胆结石也比较相似。建议患者去医院进一步检查明确病因，确定治疗方案。