输卵管造影的副作用，与输卵管造影的类型是有关系的。
比如超声下的输卵管造影。由于在造影的过程中，会对子宫内膜造成一定的损伤，所以，造影之后，患者有可能会发生宫腔或者是腹腔的感染，短期内会有少量的出血以及腹痛的症状。放射线下的输卵管造影，因为使用的是放射线，对人体多次拍片以及透视，所以，会对人体有一定的放射性。患者在检查之后3~6个月才可以进行备孕。
而且输卵管造影在检查的过程中，也会对子宫内膜造成一定的损伤，所以，也存在术后发生宫腔或者是腹腔感染的风险。也有一部分患者会对碘剂发生过敏反应。