卵巢囊肿在手术之后是否会复发，要看具体是哪一类型的卵巢囊肿，比如如果是巧克力囊肿。
在手术之后复发的几率就会相对是比较大的，畸胎瘤或者其它的卵巢囊肿确实也有的也是会存在复发的可能性，但是也并不能因为可能会存在复发而不做手术，如果卵巢囊肿的体积长到一定的程度或者是可能存在病变的问题，或者是发生了卵巢囊肿扭转了或者是发生破裂等的情况都是要考虑手术的。
手术之后有的可以选择一些治疗措施预防复发，比如巧克力囊肿手术之后可以打针、可以吃药。