肛瘘的患者不能打新冠疫苗。肛瘘是肛门周围发生感染引起的化脓性疾病，由于炎症的反复刺激，有些患者会出现发烧的症状。如果这时候打新冠疫苗，有可能会加重局部的感染症状。当身体内有炎症反应时，也有可能会影响新冠疫苗注射后抗体的形成。
有发烧的人群、上呼吸道感染、急性肺炎、急性支气管炎、慢性疾病正在急性发作期、孕妇、哺乳期的女性不能打新冠疫苗。
肛瘘的患者需要做手术才可以治愈，术后还需要用抗生素抗感染治疗，治愈肛瘘后再择期打新冠疫苗。